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■オンライン文献検索およびその関連サイト

ライフサイエンス辞書プロジェクト

金子周司
ライフサイエンス用語データベース作成グループ(京都大学医療薬理学)

生命科学・医学領域で使われる専門用語,英和・和英,用法のWeb検索、電子辞書(LSD:ライフサイエンス辞書)やツールを無償で配布している。
【Web検索】
WebLSDは2008年2月21日改訂、英和・和英・音声検索。3千万語のライフサイエンスコーパスから共起・用例を検索。医学論文で実際に使われた多数の用例が示されるため論文執筆にはきわめて有用と思います。E to Jは専門用語の単語訳を行うオンライン変換サービス、WebSpellは一般語+専門用語のオンラインスペルチェック、など。
【辞書】iTunes や iPod で生命科学の基本 2000 語の音声を訳語付きで勉強できる「耳で覚えるライフサイエンス辞書 2000」、ことえり形式・MS-IME対応「かな漢字変換辞書用テキスト」、ライフサイエンス辞書用検索ツール「Jamming Light」、「EPWING 互換形式ライフサイエンス辞書2005」などがダウンロードできる。
【追記:2006.2.5】ジャストシステムからライフサイエンス辞書Plus 2006 for ATOK が発売されるのに伴い(5,250円)、フリーのATOK用「かな漢字変換辞書用テキスト」のダウンロードができなくなりました。

論文作成の英養素

SeCera

科学英語論文サポーターサイト。論文作成テクニック集、医薬バイオ辞書、投稿規定集、科学誌リンク集、科学誌インパクトファクター、英文校正、医薬統計などの総合サイトです。科学英語論文を執筆には有用と思う。

医学中央雑誌ホームページ

医学中央雑誌刊行会

医学中央雑誌Webサイトです医中誌Webは所属する施設が契約をおこなっている場合にアクセスできます。医中誌パーソナルWebを使用するためには登録が必要です。So-net会員は登録のみで直ちに使用できます。So-netの接続会員でない方は最初に「So-net情報サービス会員」として、ID、パスワードを取得する必要があります。またはDigital e-honから使用することができます。使用料は月額2000円(6時間)または4000円(11時間)です。1ヶ月間は無料で使えます。

医中誌Webは2012年11月16日よりバージョン5となりました。「My医中誌」の新機能として、検索式の保存とメールアラートの設定ができるようになりました。「本文あり」「本文あり(無料)」の絞り込み検索とフィルター設定が行えるようになりました。検索結果の著者名の姓名間に半角スペースを出力します。

JDream II

科学技術振興機構JST

固定料金制の大学、研究機関、医療機関向け文献データベース。2006年4月1日よりJDream IIとなった。JMEDPlusは日本国内発行の資料から医学、薬学、歯科学、看護学、生物科学、獣医学等に関する文献情報、JSTPlusは科学技術(理学、工学、医学)全分野に関する文献情報、JST7580科学技術全分野に関する文献情報。MEDLINEも検索できる。

High Wire Press

Stanford大学

無料の科学ジャーナル検索サイトです。Keyword検索では、on-line journalとリンクが張られている文献のみが検索されます。オンライン雑誌はfree trial, free journal, free back issue, pay per viewに分類されています。freeの付くものはfull textや全文PDFファイルがダウンロードできます。1年(6ヶ月〜2年)を過ぎるとfreeになりものがたくさんあります(Am J Pathol, Am J Physiol, Blood, Cancer research, Circulation, Diabetes, EMBO J, Endocrinology, Hypertension, J Biol Chem, J Cell Biol, NEJM, Scienceなど)。これらFreeの Online Full-textジャーナルのリストはこちら

サンメディア学術情報サービス

サンメディア

医学洋書CD-ROM検索、学位論文検索、MEDLINE (PubMed)解説、ドキュメントデリバリー、投稿規定集などのサービス。ドキュメントデリバリーはDocumentWire、British Library Document Supply Centre、CISTI、NLMのLoansome Doc、医中誌Web DDSを扱う。

サンメディアe-Port

サンメディアの電子商品部門。Cochrane Library、医中誌Web、Webベースの文献管理ソフトRefWorksの日本語サイト、ProQuest(学位論文検索)、Medical On-line(医科系雑誌の全文)、JOIS、和雑誌特集記事データベースなどを扱う。

投稿規定

Ohio医科大学

医学生物学雑誌の投稿規定集です。ほぼすべての投稿規定を検索できます。

m3.com

ソネット・エムスリー

ソニーグループの医療従事者向け専門サイトです。旧「My Medipro」、と旧「so-net m3.com」が平成15年7月22日に統合ました。基本的に無料。1. 診療に役立つ医学webツール 「医学イラスト集」「患者配布用資料」「専門医による最新疾患解説」「国内外の医学ニュース」「医学書籍情報」「医薬品添付文書情報」「トライアルデータ ベース」など。 2. 登録した条件に合う新着文献(PubMed)をメールに自動通知。 3. 医師が創る医師の為のサイト集「診療科別のサイト集」4. MR君 顔見知りのMRと、インターネットを通じて24時間どこからでもコミュニケーションを図る。5. 優待サービス 医学書・一般書の会員優待価格、SONY製品・その他便利ツールとの交換ができるポイントシステム。有料コンテンツでは、メディカルパックAがおすすめ。月額2980円で、医中誌パーソナルWeb(6時間)、今日の治療薬、最新医学大辞典、歯科医学大事典、 治療薬マニュアル、 ハイパー臨床内科、ハイパー臨床内科、Cos版Medline、Aries版MEDLINE、Paper Chase版MEDLINE、Medical Tribuneが利用できます。

CareNet.com

CareNet, Inc

医療分野の総合サイト。医療ニュース、N Engl J Medの日本語抄録、MEDLINEウォッチ、医療禁忌、リスクマネジメント、新薬/安全情報、症例検討会、厳選プライマリケア、達人The Movie、DVD、クリニカル英会話、CareNet TVなど。

Biotechnology Japan

Nikkei Business Publications, Inc

バイオ総合情報サイト。バイオテクノロジー研究、産業化のための情報サイト。メール版ニュース、専門情報サイト(DNAチップ、糖鎖工学、HTS/マイクロアッセイ、バイオブックスタンド、ベンチャー創業、バイオインフォ、先端ゲノムなど)、機器試薬カタログ、バイオ商店街、医療関係者のホームページなど。

BKN
バイオ科学ニュース

Net BioScience News, LLC

オンラインバイオニュース月刊誌。バイオ科学、生物医学分野における重要なニュースを国際的なジャーナルから厳選して提供される。

時計台NET

トケイダイネット

大学生・大学院生のための総合リンク集。日常生活お役立ちサイト、趣味・娯楽、学術分野、大学サークル集など。当サイトの関連では、医学・歯学学生や現役医師にとって役に立つ医学・歯学リンクがある。

■オンラインICD-10(国際疾病分類第10版)検索サイト

日本語病名ICD-10

東京大学標準病名マスター作業班

ICD階層病名ブラウザ(国際疾病分類第10版1992)

病名検索ソフト 病名くん

病名検索ソフトウエア 「病名くん」、診断群分類検索ソフトウエア「ふくろうくん」がダウンロードできる。いずれもWindowsでしか使えない。

日本語病名ICD-10

三重大学医療情報部

診断群分類計算シミュレーション2003・ICD10コード検索

英語病名ICD-10 WHO: World Health Organization International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems 10th Revision Version for 2003
ドイツ語病名ICD-10 DIMDI: German Institute of Medical Documentation and Information Internationale Statistische Klassifikation der Krankheiten und verwandter Gesundheitsprobleme 10. Revision, German Modification Version 2005

■市販の文献管理ソフト

*市販ソフトとシェアウェアとの区別は、便宜的に$100以上のソフト、または年間使用料が必要なソフトを市販ソフト、それ以外のソフトをシェアウェアとして表示しました。

EndNote

X1 (Mac OS X)
X1.0.1 (Win)
07.8.20

ISI Research Soft

Mac OS X
UB
Win

[Version X]
・相対パスでのリンクによりPDFファイルへのリンク切れを回避。
・ドラッグ&ドロップでPDFファイルをリンク付け。
・Intel Macネイティブ対応など。
Mac OS 10.3.9〜10.4.x
Windows 2000SP3〜、XP SP2、Vista

2007年12月23日(日)より、医中誌Webにダイレクトエクスポート機能のエクスポート先のサービスにEndNoteが追加された。JDreamからはテキストファイルを経由して行う。ユサコからインポートフィルタを入手(登録者限定)。JDream(JMED)用 2006.2.2、JDream II用 2006.2.16。新規購入52,290円、アップグレード20,790。ProCite、ReferenceManagerからアップグレードできる。30日間の評価版のダウンロードができる。日本での販売はユサコが行っている。

ProCite
5.0 (Mac)
5.0.3 (Win)
03.11.10

Mac
Win

Mac版5.0はPubMedの変更に未対応で、直接接続による文献取り込み、テキストファイルからの取り込みのいずれもできない。また、Mac OS Xへの対応予定はない。一方、Win版5.0.3はPubMed直接接続による文献取り込み、テキストファイルからの取り込みのいずれも可能。5.0.2以下ではテキストファイルからの取り込みが可能である。事実上Win版のみが使用可能な状態である。$395.95。30日間の評価版のダウンロードができる。

Reference Manager
v11.0.1
05.10.17

Win

04.3.17にversion 11になった。PubMedのtextファイル読み込み、PubMedへの直接接続のいずれも問題ない。英語版は$395.95。日本での販売はディジタルデータマネジメントが行っている(57,000)評価版のダウンロードをして試してみることができる。

RefViz
2.0
05.04.12

Mac OS X
Win

検索文献の相互関係を視覚的にみることができる、文献管理ソフトとしてはかなり変わったソフト。PubMedからはMEDLINE形式のテキストからインポートする。EndNote、Procite、Reference Managerに出力可。30日間のDemo版ダウンロード可能。イギリスのAdept Scientificからも購入できる。130ポンド、または$299.95

WriteNote
2.5
05.8.25

Mac
Win
Linux

下記のRefWorksと同様のWebベースの文献管理ソフトでOSに依存しない。30日間の無料trialができる。

RefWorks
08.01

RefWorks/
サンメディア e-Port

Mac
Win
Linux

Webベースの文献管理ソフト。登録するとRefWorksサーバーにパーソナルデータベースが構築される。文献検索や文献選択はブラウザ上でおこなうためOSに依存しない。完成した文献リストは雑誌形式を選択してWord, RTF, Textでデスクトップに出力される。直接Pubmed検索でき、Write-N-Citeの機能によりWordで文献を書きながら文献の挿入が可能。医中誌Web、JDream(JST)、e-Infostream、Google scholarのデータを取り込むことができる。個人購読と機関購読があり、個人購読は$50/年。30日間の無料trialができる。画面はサンメディアにより日本語化されている。

GetARef 6.0日本語版
6.0.15J
05.10.13

DatAid AB

Win

スウェーデン製文献管理ソフト。日本での販売は大学生協ソフトウェア部が行っている。日本語版はPubMed、医学中央雑誌など100余りのデータベースに対応。Microsoft Wordのメニューから「GetARef」を操作可能。通常版39,800、アカデミック版 19,800、学生版 12,800、アップグレード9,800日本語版6.0J体験版のダウンロードができる。評価版は10レコードまで取り込める。

Biblioscape
7.27
new patch
08.3.22

CG Information

Win

PubMedに対応しました。MEDLINE形式のテキストファイルからインポートするか、またはbiblioscape内でPubMedを表示して検索結果をMEDLINE形式で表示しCaptureボタンで取り込むことができる。Lite: $79, Standard: $139, Pro: $299。教育機関はそれぞれ$49, $99, $199、アップグレードは$39, $69, $149評価版のダウンロードができます。

文献管理ソフトのfreeware、shareware

*市販ソフトとシェアウェアとの区別は、便宜的に$100以上のソフト、または年間使用料が必要なソフトを市販ソフト、それ以外のソフトをシェアウェアとして表示しました。

Bookends

Sonny Software

v10.2
08.3.26

share

Mac OS X
UB

v8からユニコード対応し日本語を混在できる。V9.1からuniversal binaryとなった。PubMed、Amazon(日本を含む)など多くのサイトに直接接続しインポートが可能(Reference Miner機能内臓)。WordおよびNisus Writerと連携操作可。BibTeX keyを自動生成できる。Styled text (bold, italics, etc.)とfont指定がBookendのClipboard windowに表示される。$99。50レコードまでの評価版のダウンロードができる。v9ではPDFリンク、ハンドヘルド対応。

Reference Miner

3.0
08.5.3

free

Mac OS X
UB

Amazon(日本を含む)、PubMedなどに直接接続して文献をインポートする。検索した文献はBookendsにdrag & dropで直接エクスポートできる。v2.0からuniversal binaryとなった。ダウンロードはこちら

Sente

Third Street Software

5.5.0
08.5.6

share

Mac OS X
UB

PubMed、Web of Scienceなどから直接文献をインポートできる。インポートは比較的はやい。出力形式を細かく設定してReferenceを作成できる。BibTexで出力できる。通常版$79.95、学生版 $49.95。30日間の評価版のダウンロードができる。30日を過ぎると保存ができなくなる。

iPapers2

Toshihiro
Aoyama

2.0.0
07.8.11

free

Mac OS X
UB

PubMedに直接接続して文献検索したあと、PDFが入手できる場合には入手してPMIDで管理する。論文PDF管理ソフト。

refEDITX
refEDIT.ppc

奥田 充

2.5a4
07.7.17
1.3
05.4.22

free(寄付歓迎)

Mac OS X
Mac

V1.3よりPubMedに直接接続して文献をインポートできるようになった。PDFリンクができる。PubMed(XML形式)、Current contents(Comma)、CAB/BIOSIS(Medlar)からインポートし、出力形式を設定してReference作成できる。

Ref for Windows

山本拙造

Ref 2000
3.813
08.5.6

Ref 98

free

WinNT/2000/XP
/Vista

Win NT/2000/XP/Vista用のRef2000とWin用のRef98 がある。PubMed/医中誌Webなどのタグつきテキストファイルからインポートする。文献をインターネット経由で収集するための機能、文献の作業に必要なデータベース管理の機能、論文執筆における文献引用を自動化する機能がある。BibTexファイルからインポートできる。Google scholarのデータを橋渡しするユーティリティーがある。

Citation 9 askSam Systems Inc (Oberon) 9.0
05.3.21
share Win Word/WordPerfectと協調してReferencesを作成する。タグつきテキストの文献データを変換することもできる。PubMedのデータは直接importはできないが、MEDLINEテキストファイルは変換される。法律文献用のLegal Citation もある。Citation 9 Plus $19.95をAdd onするとWeb browserから直接インポートできる。新規購入$99、アップグレード$69。30日間の評価版のダウンロードができる。

Bibliographix

Bibliographix GbR

6.2

basic: free
pro: share

Win

ドイツ製文献管理ソフト。PubMedを含め13種類のinternet上のデータベース(主にドイツ)から検索文献をdirect importできる。MS Wordと協同で文献リストを作成できる。freeのbasic versionがダウンロードできる。Pro versionは$40

蔵書管理ソフト

Delicious Library

Delicious Monster

1.6.6
07.10.23

share

Mac OS X
UB

ISSN番号やタイトルを入力するとAmazonを検索し、カバー画像、書籍データがインポートされる。書籍だけでなく映画、音楽、ゲームなども検索可能。Similarタグで同種itemが表示される。日本語対応。本棚に入っていくイメージで整理される。iSightによるバーコード読み込み可能。$40.00

Booxter

Deep Prose Software

2.0.8
08.3.18

share

Mac OS X

ISSN番号を入力するとAmazonを検索し、カバー画像、書籍データが入力される。未購入では30冊まで。$19.99。日本円でも支払い可能。iSightによるバーコード読み込み可能。日本語対応。

Books Chris Karr 3.1.8
08.3.28
free Mac OS X ISSN番号を入力するとAmazonを検索し、カバー画像、書籍データが入力される。メニューやメッセージも日本語対応。free (GNU public license)。
BookShelf HIROKI IMAI 1.0
05.3.29
free Mac OS X ISSN番号やタイトルを入力するとAmazonを検索し、カバー画像、書籍データがインポートされる。
LibraLibra Kashima Nanigashi 1.3.1
06.7.17
Screenshotware Mac OS X ISBN、書名、著者名によるオンライン検索(NDL-OPAC、NACSIS Webcat、Amazon)、自動入力。
MediaMan He Shiming 2.71.3
08.4.21
share Win ISSN番号、著者、キーワードを入力するとAmazonを検索し、カバー画像、書籍データがインポートされる。書籍だけでなく映画、音楽、ゲーム、ソフトなども検索可能。レビューが表示されるので購入前の検索にも使える。バーコード読み込み可能。$39.95
私本管理Plus EKAKIN 3.5.44
08.4.17
free Win ISSN番号やJANコードを入力するとAmazonを検索し、カバー画像、書籍データが入力される。バーコード読み込み可能。
Bookshelf Application WoodenSoldier 5.9
08.3.2
free Win ISSN番号、著者、キーワードを入力するとAmazonを検索し、カバー画像、書籍データがインポートされる。書籍だけでなく映画、音楽、ゲームなども検索可能。レビューが表示されるので購入前の検索にも使える。4.0から名称変更。旧:Amazon Application。
MyLibrary SatoyanSoft 1.30
07.11.21
share WinXP/2000 Amazonを検索、登録。ソフト上から書籍の購入可能。1365円。未登録は100冊までの制限あり。
Book Collector Collectorz.com 5.2.2(Win)
08.3.5
2.0.8(Mac)
07.11.22
share Win
Mac OS X
ISSN番号、著者、タイトルを入力するとAmazonを検索し、カバー画像、書籍データがインポートされる。$39.95。日本語表示可能。
アマゾン探検隊 RYO 12.12.05 free Win IAmazon Product Advertising API を使用し、本やCD、DVD、パソコン、すべての情報をAmazonのデータベースから取ってきて登録可能

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